La estructura del reactor IC se caracteriza por una gran relación de diámetro de altura, generalmente hasta 4 -, 8, y la altura del reactor alcanza los 20 m a la izquierda y a la derecha.Todo el reactor está compuesto por una primera cámara de reacción anaeróbica y una segunda cámara de reacción anaeróbica.En la parte superior de cada cámara de reacción anaeróbica se coloca un separador trifásico de gas, sólido y líquido.El separador trifásico de primera etapa separa principalmente biogás y agua, el separador trifásico de segunda etapa separa principalmente lodo y agua, y el lodo afluente y de reflujo se mezclan en la primera cámara de reacción anaeróbica.La primera cámara de reacción tiene gran capacidad para remover materia orgánica.El agua residual que ingresa a la segunda cámara de reacción anaeróbica puede continuar siendo tratada para eliminar la materia orgánica restante en el agua residual y mejorar la calidad del efluente.